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더 우수하고 재현 가능한 조직 이미징을 위해 모든 작업대에서 염색 자동화
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더 우수하고 재현 가능한 조직 이미징을 위해 모든 작업대에서 염색 자동화

Apr 22, 2023

Parhelia Omni-Stainer™는 시약 비용을 절감하면서 공간 생물학 프로토콜을 자동화합니다.

에서 제공하는 후원 콘텐츠

종양 미세환경은 암세포, 면역세포, 간질세포, 세포외 기질 성분의 복잡한 집합체입니다. 이러한 구성 요소 간의 상호 작용은 종양 성장과 치료 반응에 큰 영향을 미칠 수 있습니다. 종양 미세 환경을 매핑하는 우리 능력의 획기적인 발전은 공간 생물학 시대의 도래와 함께 이루어졌습니다. 이제 다양한 고도로 다중화된 이미징 기술을 사용하여 수십 개의 세포 유형을 현장에서 매핑하고 정교한 계산 알고리즘을 사용하여 종양에서의 관계를 정량적으로 모델링합니다. 문맥. 이러한 다단계 프로토콜은 비용이 많이 들고, 시료 처리량에 심각한 제한이 있으며, 분석 변동이 발생하기 쉽고 여러 실험실에서 채택하고 표준화하기 어렵습니다.

Parhelia의 비전은 개별 벤치 수준에서 책임 있는 자동화를 구현하여 연구 규정 준수, 재현성 및 견고성을 달성하는 재현 가능한 생물학의 새로운 시대를 여는 것입니다. 이 비전에서는 개별 교육과 힘든 시행착오 역엔지니어링을 통하지 않고 버튼 하나만 누르면 배포할 수 있는 다운로드 가능한 오픈 소스 자동화 스크립트를 공유함으로써 실험실 간에 프로토콜이 공유됩니다. 연구자들이 복잡한 프로토콜의 핵심적인 세부 사항에 대한 암묵적인 지식을 정확하고 명시적인 로봇 명령으로 변환하도록 강요하면 동료 커뮤니티에서 새로운 프로토콜을 신속하게 전파하고, 쉽게 채택하고, 버전을 관리하고, 독립적인 검증을 할 수 있습니다.

이러한 미래를 실현하고 공간 생물학 연구에서 늘어나는 과제를 해결하기 위해 Parhelia Biosciences는 수많은 공간 분석을 원활하게 배포할 수 있는 판도를 바꾸는 조직 염색 워크스테이션인 Omni-Stainer™를 만들었습니다. 과거의 부피가 큰 조직학 자동염색기와 달리 Parhelia Omni-Stainer™는 중간 규모 연구실의 CapEx 예산 한도(<$15,000) 내에서 의도적으로 가격이 책정된 소형 벤치탑 장치입니다.

Parhelia Omni-Stainer는 오픈 소스 SBS 형식 액체 처리기의 섀시에 구축된 모듈형 기기입니다. 모듈은 일반 슬라이드 장착 샘플뿐만 아니라 CODEX 또는 smRNA-FISH와 같은 공간 분석에서 점점 더 많이 활용되는 보다 이국적인 커버슬립 장착 샘플을 포함하여 다양한 조직 염색 형식을 수용하도록 설계되었습니다.

각 모듈은 최대 12개의 샘플을 병렬로 호스팅하며 Omni-Stainer에는 최대 10개의 모듈을 장착할 수 있어 실행당 최대 120개의 샘플을 처리할 수 있습니다. Omni-Stainer 모듈에는 프로그래밍 방식으로 제어되는 Peltier 블록을 장착할 수 있어 0~99C 범위에서 정밀한 온도 제어가 가능합니다. 이를 통해 ISH 프로토콜, DNA 결찰 및 증폭, 순환 IF 및 Opal과 같은 TSA 분석을 포함하여 온도 제어 분석을 Parhelia Omni-Stainer에 배포할 수 있습니다.

Omni-Stainer의 주요 특징인 모세관 간격 교환을 통해 효율적이고 균일한 시료 염색이 가능합니다. 샘플은 60um의 얇은 액체 모세관 층에서 배양되므로 DNA-항체 접합체 또는 FISH 프로브와 같은 값비싼 시약의 사용이 크게 줄어듭니다.

Parhelia Omni-Stainer의 뛰어난 유연성 덕분에 간단한 Python API를 통해 임의의 복잡한 프로토콜을 생성할 수 있습니다. 또한 Parhelia는 검증된 프로토콜의 공유 저장소를 포함하고 사용자가 코드를 건드릴 필요 없이 해당 프로토콜을 수정하고 실행할 수 있는 강력한 웹 앱인 StainWorks에 대한 액세스 권한을 사용자에게 제공합니다. 현재 StainWorks에는 IF, IHC, CODEX(PhenoCycler), IMC, Opal 및 RNAScope에 대한 검증된 프로토콜이 포함되어 있으며 목록은 지속적으로 확장되고 있습니다.

Parhelia Omni-Stainer는 이미 Stanford, Harvard, Broad, MD Anderson, Mayo Clinic, WUSTL을 포함한 주요 연구 기관과 Novartis 및 Genentech를 포함한 제약 R&D에 배포되었습니다.